基于自组装模型的最大团问题DNA计算算法
李肯立 罗 兴 吴 帆 周 旭 黄 鑫
2013, 50(3):
666-675.
摘要
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计量指标
DNA计算在解决NP完全问题时,有着传统图灵机无法比拟的优势. 但是随着DNA计算研究的不断深入,传统DNA计算模型显现出杂交错误率和生化操作复杂性过高的缺点. 如何提高DNA计算结果的准确性在DNA计算研究中日显重要. 针对NP完全的最大团问题,引入DNA自组装模型,提出了一种求解最大团问题的DNA计算算法. 算法通过减少实验的操作步骤数,以降低生化解的错误率,给出了DNA分子的编码方案及结果检测的实验方法. 算法设计的tiles种类为Θ(n+|E|),生化操作复杂性为Θ(1),其中n为图的顶点数,|E|为边数. 与求解最大团问题的其他DNA算法的对比分析表明,本算法不仅明显提高了生化解的准确性,且算法的生化实验复杂度低,具有良好的实验操作性.